Osoby chorujące na zespół Marfana poza wysokim wzrostem charakteryzują się też nieproporcjonalną budową ciała. Nogi i ręce są u nich wyraźnie dłuższe, nieproporcjonalnie długie w porównaniu do tułowia. Zasięg ramion jest zazwyczaj większy niż wzrost danego pacjenta. Również stosunek długości górnej i dolnej części ciała jest zmieniony.
Charakterystyczna dla tej choroby jest też pająkowatość palców. Polega na wydłużeniu kości palców rąk i stóp, przy zachowanej prawidłowej szerokości kości śródręcza i śródstopia. Osoby z zespołem Marfana zazwyczaj potrafią wykonać test kciuka (kciuk zamknięty w zaciśniętej pięści wystaje poza brzeg dłoni) oraz test nadgarstka (przy obejmowaniu nadgarstka przeciwległej ręki kciuk nakłada się na piąty palec).